MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 94661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018661	CCG	2	6	8	13	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471750
2	NC_018661	GCA	2	6	30	35	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
3	NC_018661	TAA	2	6	180	185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471750
4	NC_018661	GCGGA	2	10	212	221	20 %	0 %	60 %	20 %	407471750
5	NC_018661	TGC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
6	NC_018661	CCCGGC	2	12	372	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471750
7	NC_018661	AC	3	6	417	422	50 %	0 %	0 %	50 %	407471750
8	NC_018661	GC	4	8	460	467	0 %	0 %	50 %	50 %	407471750
9	NC_018661	GGC	2	6	468	473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471750
10	NC_018661	GTT	2	6	513	518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471750
11	NC_018661	GGC	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471750
12	NC_018661	CTG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
13	NC_018661	GC	3	6	583	588	0 %	0 %	50 %	50 %	407471750
14	NC_018661	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471750
15	NC_018661	CTA	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471750
16	NC_018661	CTG	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
17	NC_018661	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
18	NC_018661	T	6	6	727	732	0 %	100 %	0 %	0 %	407471750
19	NC_018661	TAA	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471750
20	NC_018661	CTG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471750
21	NC_018661	GACT	2	8	878	885	25 %	25 %	25 %	25 %	407471750
22	NC_018661	TGA	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471750
23	NC_018661	CGA	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
24	NC_018661	ACGT	2	8	1007	1014	25 %	25 %	25 %	25 %	407471750
25	NC_018661	GCCAAC	2	12	1045	1056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	407471750
26	NC_018661	CGTG	2	8	1086	1093	0 %	25 %	50 %	25 %	407471750
27	NC_018661	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471750
28	NC_018661	TAC	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471750
29	NC_018661	GATGGC	2	12	1236	1247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407471750
30	NC_018661	TGG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471750
31	NC_018661	ACG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471750
32	NC_018661	TGCC	2	8	1329	1336	0 %	25 %	25 %	50 %	407471750
33	NC_018661	AG	3	6	1359	1364	50 %	0 %	50 %	0 %	407471750
34	NC_018661	AGA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471750
35	NC_018661	TTA	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471749
36	NC_018661	ACA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471749
37	NC_018661	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
38	NC_018661	CTG	2	6	1517	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471749
39	NC_018661	TGG	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
40	NC_018661	CGA	2	6	1620	1625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471749
41	NC_018661	GC	3	6	1634	1639	0 %	0 %	50 %	50 %	407471749
42	NC_018661	GCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471749
43	NC_018661	GAA	2	6	1913	1918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
44	NC_018661	CGG	2	6	2044	2049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471749
45	NC_018661	GCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471749
46	NC_018661	TGG	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471749
47	NC_018661	CCG	2	6	2152	2157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471749
48	NC_018661	GAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
49	NC_018661	GCTG	2	8	2192	2199	0 %	25 %	50 %	25 %	407471749
50	NC_018661	TC	3	6	2236	2241	0 %	50 %	0 %	50 %	407471749
51	NC_018661	CAA	2	6	2302	2307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471749
52	NC_018661	GAA	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471749
53	NC_018661	ATG	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471749
54	NC_018661	TGT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471749
55	NC_018661	TTG	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471748
56	NC_018661	AGG	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471748
57	NC_018661	TTTAC	2	10	2884	2893	20 %	60 %	0 %	20 %	407471748
58	NC_018661	CGG	2	6	2898	2903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471748
59	NC_018661	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471748
60	NC_018661	AGC	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471748
61	NC_018661	GCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471748
62	NC_018661	GC	3	6	3093	3098	0 %	0 %	50 %	50 %	407471748
63	NC_018661	GCGG	2	8	3398	3405	0 %	0 %	75 %	25 %	407471748
64	NC_018661	GAT	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471748
65	NC_018661	TGA	3	9	3444	3452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471748
66	NC_018661	GCT	2	6	3462	3467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471748
67	NC_018661	CTC	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471747
68	NC_018661	GTAT	2	8	3693	3700	25 %	50 %	25 %	0 %	407471747
69	NC_018661	CAC	2	6	3731	3736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
70	NC_018661	GGT	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
71	NC_018661	CGA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
72	NC_018661	CTCTGT	2	12	3823	3834	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	407471747
73	NC_018661	CGG	3	9	3888	3896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
74	NC_018661	CGG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
75	NC_018661	GTA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471747
76	NC_018661	A	6	6	4104	4109	100 %	0 %	0 %	0 %	407471747
77	NC_018661	AGA	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
78	NC_018661	GGC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
79	NC_018661	CGTT	2	8	4293	4300	0 %	50 %	25 %	25 %	407471747
80	NC_018661	GAACAA	2	12	4309	4320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407471747
81	NC_018661	TCT	2	6	4341	4346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
82	NC_018661	CAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471747
83	NC_018661	CGG	2	6	4453	4458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
84	NC_018661	GCG	2	6	4481	4486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
85	NC_018661	AAG	2	6	4518	4523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
86	NC_018661	A	6	6	4532	4537	100 %	0 %	0 %	0 %	407471747
87	NC_018661	TCC	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471747
88	NC_018661	TCT	2	6	4646	4651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
89	NC_018661	CAG	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
90	NC_018661	GAAC	2	8	4681	4688	50 %	0 %	25 %	25 %	407471747
91	NC_018661	CTG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
92	NC_018661	TGC	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
93	NC_018661	GCG	2	6	4772	4777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
94	NC_018661	CG	4	8	4781	4788	0 %	0 %	50 %	50 %	407471747
95	NC_018661	CCG	2	6	4798	4803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471747
96	NC_018661	TGG	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
97	NC_018661	GGC	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
98	NC_018661	GC	3	6	4988	4993	0 %	0 %	50 %	50 %	407471747
99	NC_018661	CT	3	6	5006	5011	0 %	50 %	0 %	50 %	407471747
100	NC_018661	CAT	4	12	5098	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471747
101	NC_018661	GCT	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
102	NC_018661	CTT	2	6	5158	5163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471747
103	NC_018661	GCC	2	6	5215	5220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471747
104	NC_018661	GAA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
105	NC_018661	GAC	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471747
106	NC_018661	TGGC	2	8	5346	5353	0 %	25 %	50 %	25 %	407471747
107	NC_018661	CGT	2	6	5417	5422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
108	NC_018661	TATC	2	8	5449	5456	25 %	50 %	0 %	25 %	407471747
109	NC_018661	CT	3	6	5480	5485	0 %	50 %	0 %	50 %	407471747
110	NC_018661	TGG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471747
111	NC_018661	TCG	2	6	5683	5688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
112	NC_018661	GAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471747
113	NC_018661	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
114	NC_018661	CTGG	2	8	5794	5801	0 %	25 %	50 %	25 %	407471747
115	NC_018661	TCG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
116	NC_018661	TC	3	6	5821	5826	0 %	50 %	0 %	50 %	407471747
117	NC_018661	ACC	2	6	5879	5884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
118	NC_018661	GTC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
119	NC_018661	TGC	2	6	5907	5912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
120	NC_018661	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471747
121	NC_018661	CAC	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471747
122	NC_018661	CGT	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471747
123	NC_018661	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471747
124	NC_018661	TTA	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471746
125	NC_018661	AT	3	6	6100	6105	50 %	50 %	0 %	0 %	407471746
126	NC_018661	CGC	2	6	6144	6149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471746
127	NC_018661	AAG	2	6	6157	6162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471746
128	NC_018661	ATC	2	6	6182	6187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471746
129	NC_018661	ATC	2	6	6219	6224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471746
130	NC_018661	TGA	2	6	6288	6293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471745
131	NC_018661	GAG	2	6	6355	6360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471745
132	NC_018661	GGC	2	6	6364	6369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471745
133	NC_018661	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471745
134	NC_018661	GGC	2	6	6400	6405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471745
135	NC_018661	TC	3	6	6417	6422	0 %	50 %	0 %	50 %	407471745
136	NC_018661	CAAT	2	8	6447	6454	50 %	25 %	0 %	25 %	407471745
137	NC_018661	ATT	2	6	6574	6579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471745
138	NC_018661	CAC	2	6	6608	6613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471745
139	NC_018661	CTG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471745
140	NC_018661	ATGG	2	8	6817	6824	25 %	25 %	50 %	0 %	407471744
141	NC_018661	CTG	2	6	6832	6837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471744
142	NC_018661	CCG	2	6	6857	6862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471744
143	NC_018661	ACG	2	6	6913	6918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471744
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147	NC_018661	CT	3	6	7084	7089	0 %	50 %	0 %	50 %	407471744
148	NC_018661	CAC	2	6	7125	7130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471744
149	NC_018661	CTA	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471744
150	NC_018661	CCA	2	6	7187	7192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471744
151	NC_018661	TGA	3	9	7250	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471744
152	NC_018661	TGA	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471744
153	NC_018661	GAA	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471744
154	NC_018661	AAG	2	6	7523	7528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471744
155	NC_018661	TGGCG	2	10	7563	7572	0 %	20 %	60 %	20 %	407471744
156	NC_018661	ATT	2	6	7647	7652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471743
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159	NC_018661	ATGG	2	8	7788	7795	25 %	25 %	50 %	0 %	407471743
160	NC_018661	TCT	2	6	7925	7930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471743
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165	NC_018661	TGG	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471742
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168	NC_018661	GAT	2	6	8974	8979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471742
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172	NC_018661	GAAC	2	8	9113	9120	50 %	0 %	25 %	25 %	407471742
173	NC_018661	GGC	2	6	9217	9222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471742
174	NC_018661	CGAC	2	8	9419	9426	25 %	0 %	25 %	50 %	407471741
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181	NC_018661	CT	3	6	9663	9668	0 %	50 %	0 %	50 %	407471741
182	NC_018661	TTATG	2	10	9669	9678	20 %	60 %	20 %	0 %	407471741
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251	NC_018661	AGTT	2	8	13765	13772	25 %	50 %	25 %	0 %	407471737
252	NC_018661	CTG	2	6	13829	13834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471737
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255	NC_018661	GCGG	2	8	13919	13926	0 %	0 %	75 %	25 %	407471737
256	NC_018661	ATC	2	6	13973	13978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471737
257	NC_018661	TGG	2	6	14026	14031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471737
258	NC_018661	GCG	2	6	14112	14117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471737
259	NC_018661	CAG	2	6	14216	14221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471737
260	NC_018661	CCG	2	6	14223	14228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471737
261	NC_018661	AAT	2	6	14339	14344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471737
262	NC_018661	ACCAAT	2	12	14505	14516	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407471736
263	NC_018661	CGT	2	6	14569	14574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471736
264	NC_018661	CGAGGT	2	12	14615	14626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407471736
265	NC_018661	TATC	2	8	14627	14634	25 %	50 %	0 %	25 %	407471736
266	NC_018661	GTG	2	6	14661	14666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471736
267	NC_018661	TGA	2	6	14720	14725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471736
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275	NC_018661	AATC	2	8	15068	15075	50 %	25 %	0 %	25 %	407471736
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279	NC_018661	ACC	2	6	15237	15242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471736
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285	NC_018661	GCG	2	6	15547	15552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471736
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289	NC_018661	GGC	2	6	15645	15650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471736
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387	NC_018661	A	6	6	22045	22050	100 %	0 %	0 %	0 %	407471729
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389	NC_018661	CGG	2	6	22094	22099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471729
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